案例：細胞作為趨化因子
上篇ibidi細胞趨化應用中（見鏈接： ）以Dendritic cell對CCL19細胞趨化反應為例介紹了細胞趨化的新方法。
本案例將介紹如何用細胞作為細胞運動的化學趨化因子。
如圖所示：觀測通道中可以使用貼壁細胞，或者是3D培養的細胞。用于趨化的細胞可以直接注入其中一個儲液池中（圖一）。 
圖一：A待觀察細胞為貼壁細胞，受到左邊的儲液池中細胞影響具有了趨化行為。B待觀察細胞為3D培養細胞，在基質膠中同樣也受到了儲液池中的細胞的影響具有趨化行為。
一、實驗材料準備：
1.儀器：
● 細胞培養箱（高濕度，37℃，5%CO2）
● 倒置顯微鏡，具有10X相差物鏡和定時拍照功能
● 鏡載加熱孵育系統（37℃，5%CO2）
● 可選配置：全自動載物臺，自動對焦系統
● 分析軟件：可選用手動分析軟ImageJ的“Manual Tracking”模塊，或全自動的ibidi提供的WimTaxis進行細胞軌跡追蹤。使用ibidi公司的“Chemotaxis and Migration Tool” 進行數據統計分析。
1.實驗材料準備：
實驗前一天準備工作：
為了減少ibidi細胞趨化載玻片與培養基中的氣泡，將載玻片和培養基提前24小時放入培養箱中
表三：制備1.6mg/ml 基質膠
操作步驟：
● 使用表一中的培養基制備 9 x 106 cells/ml 的細胞懸液
● 在1.5ml離心管中小心混勻表三中的1和2號試劑，避免產生氣泡
● 在另一1.5ml離心管中準備150 μl collagen I
● 使用槍頭從混合液中吸取30μl（圖一A）
● 小心混勻（圖一B），避免產生氣泡
● 加入90μl細胞懸液到上一步混合液中（圖一C）
● 小心混勻（圖一D），避免產生氣泡
圖一：制備細胞-基質膠混合液圖示，注意：1）避免產生氣泡，氣泡會破壞膠原纖維，不能使用Vortex；2）膠原混合后，離膠凝大約有5分鐘時間，如果在凝膠后再進行操作會破壞膠原纖維；3）當剛加10x MEM到NaHCO3中的時候會看到顏色變化，這表明沒有充分反應，因此加入混合液到膠原蛋白中后要充分混勻。
一.細胞趨化實驗
1.趨化試劑
● 細胞趨化物：作為趨化因子的細胞 1-5 x 105 cells/ml
● 培養基：建議使用同一種培養基，并且需要優化一下血清濃度，建議使用低濃度的血清，減少由于血清造成的生長因子而減弱了趨化造成的影響。
1.實驗步驟
開始細胞實驗之前，要準備一個濕盒將細胞趨化載玻片放在濕盒中。可以用一個放了浸濕的紙巾的10cm培養皿作為濕盒（如圖二）。
貼壁細胞準備：
● 如圖，用小塞子將C、D、E、F塞緊。使用20μl的槍頭從A中加入6μl細胞懸液。并使用同一個槍頭立即從B孔向外吸。直到觀測通道被細胞懸液充滿。
● 在注液孔中加入培養基到圖示位置（圖三(B)）。移走所有小塞子。將載玻片放在培養箱中等待細胞貼壁。
圖三：(A)示意向觀測通道中加入帶觀測細胞懸液。(B)圖表示注液孔的切面圖。
● 1-5小時后，用顯微鏡檢查細胞是否完全貼壁，如果完全貼壁，需要更換培養基。用小塞子將C、D、E、F塞緊。從A中加入10μl新鮮培養基。注意不要加入氣泡。同樣用同一個槍頭從B向外吸。
● 重復三次。
● 在注液孔中加入培養基到圖示位置（圖三(B)）。移走所有小塞子，將A、B孔塞緊，準備開始趨化實驗。
圖四：細胞貼壁后用無細胞培養基更換觀測通道中的培養基。
3D細胞準備
● 如圖，用小塞子將C、D、E、F塞緊。使用20μl的槍頭從A中加入6μl細胞-基質膠混合液。并使用同一個槍頭立即從B孔向外吸。直到觀測通道被細胞-基質膠混合液充滿。
● 在注液孔中加入基質膠到圖示位置（圖五(C)）。移走所有小塞子。小心將A、B孔塞緊，將載玻片放在培養箱中30-35分鐘，等待膠凝固后開始趨化實驗。
圖五：(A)向觀測通道加入細胞-基質膠混合液。(B)用同一個槍頭從另一個孔中向外細。(C)注液孔切面圖。(D)將A、B口塞緊，開始趨化實驗。
加入趨化細胞：
● 細胞貼壁或膠凝固后，將C、D兩個孔用塞子塞緊。從E中加入65μl新鮮培養基，充滿整個儲液池。（圖六）
● 再小心移除C、D兩孔的塞子。把E、F兩孔塞緊，同樣的操作從C加入65μl培養基。
● 用20μl槍頭從C中加入15μl作為趨化因子的細胞懸液，用同一個槍頭從D中吸出15μl。
● 重復上步操作，加入總量30μl的細胞懸液。
● 將所有孔塞緊，靜置30分鐘后，就可以進行圖像采集。
圖六：加入作為趨化因子的細胞。需先用無細胞的培養基將儲液池充滿，再逐漸加入細胞，加入后將所有塞子塞緊靜置一會，再開始實驗。
● 對照，在兩邊儲液池中均加入60μl的無化學趨化物培養基作為空白對照（-/-），和兩個儲液池均加入30μl細胞懸液作為陽性對照（+/+）。
● 按說明，將通道加液孔塞緊后可以進行圖像采集。
● 將載玻片置入鏡載加熱孵育系統中，調整好采集位點，開始錄制實驗結果。
三、圖像處理
1.手動細胞軌跡追蹤
● 下載ImageJ，并安裝Manual Tracking模塊
● 導入采集的系列圖像到ImageJ中，打開模塊“Manual Tracking”，選擇“Add track”開始記錄細胞軌跡
● 選擇一個細胞，按照時間點單擊細胞，點擊后，會有新窗口跳出來顯示初始位置，以后每次點擊，都將在這個新窗口中產生一個該細胞隨著時間的新坐標
● 統計完足夠的細胞軌跡后，保存軌跡坐標表格
● 至少收集30個細胞的軌跡才具有統計學意義，避免同一細胞追蹤兩次，去除由于凋亡會而不能采集完整的軌跡的細胞
● 可以將“Overlay dots & lines”以.avi格式導出
2）全自動細胞軌跡追蹤
使用ibidi的WimTaxis自動分析平臺，將采集的系列圖像上傳到該平臺，幾個工作日后，會得到細胞軌跡的坐標表格數據結果。
四、數據處理
使用遷移指數（ Forward Migration Indices*，FMIs）作為比較趨化實驗和對照試驗的參數。在有趨化物的情況下，空白對照的FMI和與趨化物垂直方向的化學趨化的遷移指數（FMI┴）應是在0點左右。而與趨化物平行方向的化學趨化的遷移指數（FMI‖）與0點有顯著的區別表現出了化學趨向性。同時，使用Rayleigh Test**對細胞趨化的方向性進行檢驗。如果p值大于0.05表示了細胞運動的無序性，表明沒有方向性的遷移。此外，遷移速率等參數也能直接用于分析。
*Foxman et al. Integrating conflicting chemotactic signals. The role of memory in leukocyte navigation, J Cell Biol 147, 577-588 (1999)
**Fisher, N. I. Statistical Analysis of Circular Data, Cambridge University Press, New York (1993)
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